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| 長崎県 | ||||
| 施設名 | 所在地 | 施設名 | 所在地 | |
| 長崎市ド・ロ神父記念館 | 長崎市 | 佐世保市博物館島瀬美術センター | 佐世保市 | |
| 長崎市外海子ども博物館 | 長崎市 | 西海国立公園九十九島水族館海きらら | 佐世保市 | |
| 長崎市外海歴史民俗資料館 | 長崎市 | ハウステンボス美術館・博物館 | 佐世保市 | |
| 長崎原爆資料館 | 長崎市 | 島原城 | 島原市 | |
| 長崎市科学館 | 長崎市 | 雲仙岳災害記念館がまだすドーム | 島原市 | |
| シーボルト記念館 | 長崎市 | 平成新山ネイチャーセンター | 島原市 | |
| 長崎市永井隆記念館 | 長崎市 | さかきばら郷土史料館 | 島原市 | |
| 長崎市須加五々道美術館 | 長崎市 | しまばら水屋敷 | 島原市 | |
| 聖コルベ館 | 長崎市 | 諫早ゆうゆうランド干拓の里 | 諫早市 | |
| 祈りの丘絵本美術館 | 長崎市 | 諫早市美術・歴史館 | 諫早市 | |
| 長崎市べっ甲工芸館 | 長崎市 | 大村市歴史資料館 | 大村市 | |
| 長崎市旧香港上海銀行長崎支店記念館 長崎近代交流史と孫文・梅屋庄吉ミュージアム | 長崎市 | 平戸市生月町博物館「島の館」 | 平戸市 | |
| 長崎市野口彌太郎記念美術館 | 長崎市 | 平戸市切支丹資料館 | 平戸市 | |
| 出島（出島史料館本館・分館・二番蔵） | 長崎市 | 松浦史料博物館 | 平戸市 | |
| ナガサキピースミュージアム | 長崎市 | 平戸オランダ商館 | 平戸市 | |
| グラバー園 | 長崎市 | 対馬博物館 | 対馬市 | |
| 大浦天主堂 | 長崎市 | ”電力の鬼”松永安左エ門記念館、ふるさと資料館 | 壱岐市 | |
| 長崎県美術館 | 長崎市 | 壱岐市立一支国博物館 | 壱岐市 | |
| 国立長崎原爆死没者追悼平和祈念館 | 長崎市 | 遣唐使ふるさと館 | 五島市 | |
| 長崎歴史文化博物館 | 長崎市 | 五島観光歴史資料館 | 五島市 | |
| サント・ドミンゴ教会跡資料館 | 長崎市 | 堤けんじ西海たぬき絵ギャラリー | 西海市 | |
| 清水崑展示館（長崎市中の茶屋） | 長崎市 | 雲仙公園ビジターセンター 雲仙お山の情報館 | 雲仙市 | |
| 長崎市歴史民俗資料館 | 長崎市 | 山本美術館 | 雲仙市 | |
| 長崎ペンギン水族館 | 長崎市 | 土石流被災家屋保存公園 | 南島原市 | |
| 日本二十六聖人記念館 | 長崎市 | 火山学習館・大火災流体験館 | 南島原市 | |
| 海上自衛隊佐世保史料館 | 佐世保市 | 口之津町歴史民俗資料館・海の資料館 | 南島原市 | |
| ガラスの丘美術館 | 佐世保市 | 有馬キリシタン遺産記念館 | 南島原市 | |
| 西海国立公園九十九島動植物園森きらら | 佐世保市 | 東彼杵町歴史民俗資料館 | 東彼杵郡東彼杵町 | |
| 佐世保市うつわ歴史館 | 佐世保市 | 小値賀町歴史民俗資料館 | 北松浦郡小値賀町 | |
| 三川内焼美術館 | 佐世保市 | 新上五島町鯨賓館ミュージアム | 南松浦郡新上五島町 | |